醫療保險檔案是醫療保險經辦機構在醫療保險工作中形成的文字、圖表、照片、電子、數據等形式的具有保存價值的原始記錄，是醫療保險機構、參保單位和個人直接使用的原始資源，是整個醫療保險事業的真實記錄和歷史反映。

醫院綜合檔案室對于醫療文書檔案、X 線膠片檔案、病理切片檔案、各種檢查影像圖文檔案、醫療設備檔案等都分屬各個科室分散管理，形成了多部門管理檔案的格局，不利于檔案的完整和安全。檔案管理設施不全，檔案現代化管理水平不高。目前大部分醫院存在著檔案庫房不夠規范，檔案管理設施不全，檔案設備比較陳舊、管理技術落后等問題，制約了醫療檔案管理工作的發展。